Der wissenschaftliche Beirat des FiBL Schweiz berät dessen Geschäftsleitung in inhaltlicher und methodischer Ausrichtung der Forschungs- und Beratungstätigkeit. Er setzt sich zurzeit aus acht Wissenschaftlerinnen und Wissenschaftlern unterschiedlicher Fachdisziplinen zusammen und tagt jährlich. Gewählt werden die Mitglieder des wissenschaftlichen Beirates von der Geschäftsleitung des FiBL Schweiz.

Eidgenössische Technische Hochschule (ETH), Zürich und Universität Lausanne, Lausanne, Präsidentin
Landesforschungsanstalt für Landwirtschaft (LfL), Freising
Veterinärmedizinische Universität Wien, Wien
Julius-Kühn-Institut (JKI), Dossenheim
Deutsches Institut für Tropische und Subtropische Landwirtschaft (DITSL), Witzenhausen
Eidgenössische Forschungsanstalt für Wlad, Schnee und Landschaft (WSL), Birmensdorf
Eidgenössische Technische Hochschule (ETH), Zürich
Scotland's Rural College (SRUC), Aberdeen