Der Stiftungsrat hat als oberstes Gremium die Gesamtverantwortung für das Institut. Er bestimmt die Tätigkeitsschwerpunkte des FiBL und vertritt dieses in strategischen, inhaltlichen und finanziellen Fragen nach aussen.

Präsident Stiftungsrat
 Steering Committee HLPE des CFS-FAO (Welternährungssicherheit)
 Ehem. Ordinarius für Agrarökonomie, ETH und ehem. Direktor Bundesamt für Landwirtschaft (BLW)

Vizepräsidentin Stiftungsrat
 Nationalrätin, Umweltnaturwissenschafterin

Bäuerin
 Aargauer Grossrätin
 Vizepräsidentin Bauernverband Aargau

Berater, Unternehmer

Präsident Bio Suisse

Rechtsanwältin
 Präsidentin des Schweizerischen Bäuerinnen- und Landfrauenverbandes (SBLV)
 Vizepräsidentin des Schweizerischen Bauernverbands

Rechtsanwältin
 Mitbegründerin der Fondation Opaline

Dozent für Markenführung, Berater, Unternehmer

Landwirt, Alt Nationalrat

Leiter Nachhaltigkeit / Wirtschaftspolitik bei Coop