Les quatre départements de recherche ainsi que le Département vulgarisation, formation & communication, le Département de la coopération internationale, le Département finances & infrastructure et le Département ressources humaines & administration du FiBL en Suisse se trouvent sur le site à Frick. Les locaux du Département Suisse Romande sont, quant à eux, situés à Lausanne.
L'organigramme donne un aperçu de tous ces domaines d’activité.