Le FiBL a tissé de nombreux partenariats aux niveaux national et international, notamment dans le domaine de la coopération en matière de recherche et des échanges avec les praticiennes et praticiens ainsi qu'avec des bailleurs de fonds.
Le FiBL entretient des relations privilégiées avec les instituts qu'il a cofondés et les entreprises dans lesquelles il détient une participation.
IFOAM Organics International
Le FiBL est un membre actif de l'IFOAM, la Fédération internationale des mouvements d'agriculture biologique. Depuis plus de 50 ans, ces deux organisations sont des partenaires stratégiques étroits dans le développement de l'agriculture biologique à l'échelle internationale.
ifoam.bio: site web de l'IFOAM
Bio Suisse
En 1981, le FiBL a été l'un des cofondateurs de Bio Suisse, la fédération faîtière des agricultrices et agriculteurs bio suisses. Les deux organisations entretiennent une collaboration stratégique en vue de développer l'agriculture biologique en Suisse, notamment dans le domaine de la recherche et sa mise en pratique.
bio-suisse.ch: site web de Bio Suisse
IFOAM Organics Europe
Le FiBL est un membre actif d'IFOAM Organics Europe, la branche européenne de l'IFOAM. Depuis sa création en 2002, le FiBL apporte son expertise technique et scientifique au niveau européen dans le cadre de cette coopération stratégique.
organicseurope.bio: site web d'IFOAM Organics Europe
L'IBLA au Luxembourg
L'IBLA est l'Institut pour l'agriculture biologique et la culture agraire au Luxembourg. Le FiBL a participé à sa fondation en 2007.
Ibla.lu: site web de l'IBLA
L'ÖMKi en Hongrie
Le FiBL entretient des liens étroits avec l'ÖMKi, l'Institut hongrois de recherche en agriculture biologique. Il a joué un rôle déterminant dans la création de l'institut en 2011.
biokutatas.hu: site web de l'ÖMKi